Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ScaperF8VQ70 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ScaperF8VQ70 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms