Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r76F8VQ63 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r76F8VQ63 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms