Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BicraF8VPZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BicraF8VPZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
BicraF8VPZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms