Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5861F6VCN9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5861F6VCN9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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