Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pagr1bF6V0H0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms