Protein–RNA interactions for Protein: F6TQW2

Ighg2c, Immunoglobulin heavy constant gamma 2C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg2cF6TQW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ighg2cF6TQW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ighg2cF6TQW2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighg2cF6TQW2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms