Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm340F6RGI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm340F6RGI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms