Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lmod3E9QA62 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmod3E9QA62 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod3E9QA62 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms