Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srsf11E9Q6E5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms