Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gcnt4E9Q649 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt4E9Q649 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt4E9Q649 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcnt4E9Q649 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gcnt4E9Q649 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gcnt4E9Q649 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gcnt4E9Q649 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Gcnt4E9Q649 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Gcnt4E9Q649 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcnt4E9Q649 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms