Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd1E9Q3H4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd1E9Q3H4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms