Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
NebE9Q1W3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NebE9Q1W3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms