Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc171E9Q1U1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc171E9Q1U1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms