Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp3E9Q1T6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrp3E9Q1T6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms