Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Vmn2r80E9Q1L0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn2r80E9Q1L0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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