Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r68E9Q0V3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms