Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt78E9Q0F0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt78E9Q0F0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms