Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ryr1E9PZQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms