Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gcom1E9PZ54 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcom1E9PZ54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms