Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srp54bE9PXC0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp54bE9PXC0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.4 ms