Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn4E9PX29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn4E9PX29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms