Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rsf1E9PWW9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rsf1E9PWW9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rsf1E9PWW9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rsf1E9PWW9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms