Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG8

9530053A07Rik, RIKEN cDNA 9530053A07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 2,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530053A07RikE9PVG8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
9530053A07RikE9PVG8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
9530053A07RikE9PVG8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
9530053A07RikE9PVG8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms