Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp839E9PUU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp839E9PUU5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp839E9PUU5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms