Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syde2E9PUP1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.1 ms