Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5430403G16RikD3Z5L4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5430403G16RikD3Z5L4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5430403G16RikD3Z5L4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms