Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif28pD3YXS5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif28pD3YXS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms