Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd1D3YXK1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd1D3YXK1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd1D3YXK1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms