Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim30cD3YVI9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim30cD3YVI9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms