Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms