Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tmf1B9EKI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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