Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r180B9EK86 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r180B9EK86 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms