Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Syce3B5KM66 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syce3B5KM66 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms