Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pnldc1B2RXZ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pnldc1B2RXZ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms