Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppfia1B2RXQ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppfia1B2RXQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms