Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp26c1B2RXA7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp26c1B2RXA7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp26c1B2RXA7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms