Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zscan5bB2RTN3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zscan5bB2RTN3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms