Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc22a28B2RT89 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc22a28B2RT89 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc22a28B2RT89 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms