Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2012B1B0R1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2012B1B0R1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms