Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4930402K13RikB1AW18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930402K13RikB1AW18 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms