Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtpruB1AUH1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtpruB1AUH1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtpruB1AUH1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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