Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss40A6H6T1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss40A6H6T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss40A6H6T1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss40A6H6T1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss40A6H6T1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prss40A6H6T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss40A6H6T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms