Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odf2A3KGV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms