Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp8b5A3FIN4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp8b5A3FIN4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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