Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trmt1lA2RSY6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trmt1lA2RSY6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms