Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Btbd35f28A2CFD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Btbd35f28A2CFD5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms