Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Upf2A2AT37 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Upf2A2AT37 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms