Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef17A2ASJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef17A2ASJ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms