Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SktA2AQ25 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SktA2AQ25 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SktA2AQ25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms