Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SetxA2AKX3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SetxA2AKX3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SetxA2AKX3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms